El Jardín de Balamb, ese es el hogar de Squall Lionheart, nuestro protagonista. El Jardín no es más que una escuela de lucha que entrena a sus almnos para convertirlos en Seeds, soldados de élite que acuden a conflictos a cambio de un buen pago.

Al comienzo de la historia nos encontramos en la etapa de los últimos examenes para por fin alcanzar el rango de Seed. Entre los alumnos que se examinan se encuentra el ya mencionado Squall, posiblemente uno de los mejores luchadores de toda la escuela junto a Seifer, un personaje orgulloso que desde siempre a tenido una gran rivalidad con el protagonista.
Desde que comencemos al aventura poco a poco conoceremos a nuevos compañeros de trabajo con el rango de Seed como Zell o Selphie, pero entre ellos destacará Rinoa Heartilly, a la que Squall verá por primera vez durante la fiesta que se organiza para celebrar el aprobado de los nuevos Seeds.

El destino queire que la primera misión asignada a Squall sea una encargada por la propia Rinoa, ninguno de los dos se imaginaba lo que esa primera misión conllevaria tanto para ellos como para todo el planeta. A lo largo dela aventura se destaparán muchos secretos ocultos que llevarán al grupo a luchar contra enemigos imposibles para preservar la estabilidad del mundo que conocen.